来源:蜘蛛抓取(WebSpider)
时间:2011-10-20 09:52
标签:
定量pcr
关注今日:0 | 主题:287847
微信扫一扫
【求助】普通PCR可以扩出来,换定量PCR为什么就扩不出来呢?
页码直达:
这个帖子发布于4年零108天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
引物、试剂和参数设置都是一模一样的,同样的条件在普通PCR仪上扩增良好,电泳见到了单一的目的条带;去定量PCR仪上扩却扩不出来了,Ct值基本上35-45之间!产物电泳也什么都看不到。用的是ABI StepOne。试剂都是TAKARA的预混试剂,含SYBR Green 1染料;模板DNA按说也都没有问题。真是郁闷极了。会是什么原因呢?
不知道邀请谁?试试他们
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
能把反应条件说一下吗?仪器设置的有没有问题呢?
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
tiantian 能把反应条件说一下吗?仪器设置的有没有问题呢?1.预变性 95℃,3min;2.变性 95℃,30s;3.退火 55℃,30s;4.延伸 72℃,50s;5.延伸 72℃,10min;(step2—4,45个循环)溶解曲线:75℃——95℃,0.2℃/s。反应条件是前人在做的过程中摸索出来的,基本照搬了(和别人用的PCR仪、试剂不完全相同);对ABI StepOne仪器虽然不甚熟悉,但是有较熟悉的同学指导,应该不会有大的问题啊。曾经在DA7600的定量PCR仪上做过预实验,内参及阴性对照、引物、体系、反应条件均可,内参及目的基因扩增Ct值25左右。在普通PCR仪上也用相同条件扩增过,产物电泳分析确为单一目的条带。当然了,每次扩增用的不是同一个模板cDNA,但是理论上相差不远。谢谢支持!求思路啊!
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
我这出现过一种情况,过去能扩增的体系忽然扩增效率大降甚至扩增失败,必须添加BSA成分的buffer才能正常扩增,可以尝试添加终浓度为0.01%的BSA试试,可能跟耗材有一定关系
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
既然只有仪器不同,那只能在仪器方面找原因了pcr仪器的性能主要有两点:1,温度的准确度;2,温度的升降速率这两个参数对检测影响很大,建议找厂家校准温度不同仪器建议重新摸条件还有就是感觉你发上来的条件不像是做荧光定量pcr的条件,一般荧光定量是两步法,即没有延伸这一步,因为荧光定量pcr产物一般在150bp左右,不知道你的片段多大即便是用三步法延伸这个一步只需要15’左右即可,如果50‘这得是扩多大的条带啊
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
yangrui2006114 1.预变性 95℃,3min;2.变性 95℃,30s;3.退火 55℃,30s;4.延伸 72℃,50s;5.延伸 72℃,10min;(step2—4,45个循环)溶解曲线:75℃——95℃,0.2℃/s。反应条件是前人在做的过程中摸索出来的,基本照搬了(和别人用的PCR仪、试剂不完全相同);对ABI StepOne仪器虽然不甚熟悉,但是有较熟悉的同学指导,应该不会有大的问题啊。曾经在DA7600的定量PCR仪上做过预实验,内参及阴性对照、引物、体系、反应条件均可,内参及目的基因扩增Ct值25左右。在普通PCR仪上也用相同条件扩增过,产物电泳分析确为单一目的条带。当然了,每次扩增用的不是同一个模板cDNA,但是理论上相差不远。谢谢支持!求思路啊!每次扩增用的不是同一个模板cDNA,但是理论上相差不远。没有理论吧,要确保模板质量没问题哦。
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
seuzsl 既然只有仪器不同,那只能在仪器方面找原因了pcr仪器的性能主要有两点:1,温度的准确度;2,温度的升降速率这两个参数对检测影响很大,建议找厂家校准温度不同仪器建议重新摸条件还有就是感觉你发上来的条件不像是做荧光定量pcr的条件,一般荧光定量是两步法,即没有延伸这一步,因为荧光定量pcr产物一般在150bp左右,不知道你的片段多大即便是用三步法延伸这个一步只需要15’左右即可,如果50‘这得是扩多大的条带啊嗯,最早是没有用荧光定量PCR的,只在普通PCR扩增,目的条带大约200bp;后来在原先的实验基础上做了部分改进,但是改过之后需要用定量PCR,现在设置的条件是在之前条件基础上稍作修改的;因为已有前人做过,所以没有再做修改。或许是模板的问题,我们提取的总RNA没有问题,但是反转录之后就不清楚了啊。昨天换了一个cDNA重新做,终于看到扩增曲线,虽不甚完美,也心安了许多。谢谢支持!我们今后会注意探索反应条件,对荧光定量PCR知识真的了解太少了,学习!
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
sdhjw2008 每次扩增用的不是同一个模板cDNA,但是理论上相差不远。没有理论吧,要确保模板质量没问题哦。嗯,是啊,虽然确定了所提的RNA没有问题,可是反转录过程就不好说了……昨天我们换了一个模板,居然扩出来了,不是很完美的结果,但也过得去,很是开心啊!只是很不明白,为什么那份cDNA就不行,RNA是没问题的,反转录我们也做了那么多次了,误差应该很小的……如果找不到那份cDNA异常的原因,以后就还可能出现这样的问题啊。
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
轩辕顽童 我这出现过一种情况,过去能扩增的体系忽然扩增效率大降甚至扩增失败,必须添加BSA成分的buffer才能正常扩增,可以尝试添加终浓度为0.01%的BSA试试,可能跟耗材有一定关系嗯,因为买的是比较省事的试剂盒,想着一般试剂盒里的东西都是比较好用不必操心的;我们用的pcr反应管倒真是很便宜的,担心会影响荧光信号检测,打算换进口的好一些的管子
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
关于丁香园荧光定量PCR完全攻略&(转)
PCRPCRPCRPCRPCR
nPCR100%PCRDNA2Y= X(1+E)n E E =
1105n30E n&30EY
PCRPCRPCRPCRPCR
Tn=Tn-11+En [0
EnTnnPCRTn-1n-1PCRT0PCR(K1010)CPcrossing point,K= T01+ECP
T0+CP*lg(1+E)
1/lg(1+E)*lg T0 +lgk/lg(1+E)
PCREKCPlg T0y=kx+b,- 1/lg(1+E)lgk/lg(1+E)PCRRT-PCR
PCR(Slope)- 1/lg(1+E)E=10-1/Slope-1 ,Slope=-3.337,E=101/3337-1=0.99,(1+E)EE=10-1/SlopeE122PCR10PCRN2=N0En2, N3=(10*N0)En3,N2=N3En2-n3=10,ngE=1, E=101/nE=2n=3.32; E=1.8n=3.91.
SYBR Green I
SYBR Green
Green IPCRDNASYBR Green I 497nm520nmPCR94557240
SYBR Green
I SYBR Green
SYBR Green ISYBR Green IDNA
PCRPCR-ELISAPCR1PCRPCR2cDNAPCRmimic3PCRPCR96PCR96PCR
2PCRPCR301010/452396
APCRPCRPCRPCR
BPCRPCRCtPCR
2CtCtPCRTexas
PCRPCRPCRPCRPCR
1)genebankwww.ncbi.nlm.nih.gov
2)Primer5.0Oligo6.0beacon designs3.0www.
D2025bp,Tm5565GC40%60%100-250bp
B2030bpTm6570510GC40%70%
3blast(www.ncbi.nlm.nih/blast)
4FAMTexas redLC-Red640LC-Red705PCRTaqmanbeacon
6120bpPCRPCRTEDNA6.0102345107/ml106/ml105/ml104/ml103/ml
725pmol/ul2025pmol/ulul
(OD33)40000
1PCR buffer0.3-0.5pmol/ul0.10.3pmol/ul2.5-4.0mMMg2+1-2UTaq0.20.4mMdNTPs0.2-1UUNG0.3-0.6mMdUTP2-5ul2050ul
lightcycler502
blastprimer
803PCREDTAPCRKRNA
CPCR10%75%10%70%
PCRdUTPUNG4
Q-PCRPCRPCRreal-time 190Taq DNA5PCR2real-time Q-PCR
PCRDNAPCRPCRPCRPCRreal-time Q-PCRPCRPCRPCRPCRreal-time Q-PCRthresholdPCR15baseline31510CtCtCtCtCt
DNASYBR green 1Real-time Q-PCRPCRSYBR green 1SYBR green 1DNAdsDNAdsDNAdsDNAmelting curve
PCRreal-time Q-PCRTaqManPCR53FRET5PCRTaq5-353DNAPCR
molecular beaconDNAPCRPCRsunrise primesscorpion primeshybridization probe3donor5acceptorPCRFRETmelting curve
1*nRNADNAbeta-actin,3-GAPDH
CTPCRCTCT=12
DNARNA260nmDNARNA
Q-PCRmRNADNASNPsreal-time Q-PCR
MRDReal-time Q-PCRAMLt(821) (q 22q22)AML-18MTG8AML-1real-time Q-PCRMRDCMLBCR-ABLALLTEL-AML1FLt(14;18)(q32;q21)bcl-2real-time Q-PCRReal-time Q-PCR
IL-1IL-23IFN-IFN-CSFTNFTGF-MCP-1MIP-1mRNAreal-timePCRRT-PCR
ATPATP-binding cassette
superfamilyMDR-1P-P-gpMRPLRPBCRPTopoGSH-S-GSTCPKCdeoxycytidine kinasebcl-2p53c-mycMDRreal-timePCRRT-PCRmRNA
Q-PCRPCRreal-time Q-PCRmRNARNARTPCRReal-time Q-PCR12real-time Q-PCRmultiplex3real-time Q-PCR
以上网友发言只代表其个人观点,不代表新浪网的观点或立场。当前位置: >>
鸭IFN-γ mRNA实时荧光定量RT-PCR方法的建立
维普资讯 动 物医学 进展 ,0 8 2 ( ) 1 ―0 2 0 ,9 5 :72 Pr r s n Ve e i a y M e i i og e si t rn r d cne鸭 I N一 mRNA 实 时 荧 光 定 量 RT― C 方 法 的 建 立 F P R谢 秀 兰 , 。 汤 承 杨 发 龙 岳 华 , ,( . 南 民族 大 学 生 命 科 学 与 技 术 学 院 。 1西 四川 成都 6 04 ;. 北 医 学 院 微 生 物 与 免 疫 学 教 研 室 , 10 1 2 川 四川 南 充 6 70 ) 30 0 摘 要 : 建立检 测 鸭 I N一 为 F mR NA 表 达的 实时荧光定 量 R P R方 法 , 据 Oe B n T― C 根 n a k中鸭 I N一 F 基 因序 列 , 在保 守区域 设计 并合 成 一对 引物 , 用 S R Gre 染料 , 立检 测 鸭 I N一 采 YB enI 建 F mRNA 的 实 时荧光 定量 R - C 方法 (e l i T P R 。试验 以 P R产物 为标 准 品 , 立标 准 曲线 , TP R ra t ― meR ― C ) C 建 随后 进 行 熔 解 曲线分 析和 稳定性研 究。结 果 C 值 线性 范 围为 1 . ~3 . , 关 系数 为 0 9 7 熔 解 曲线 显 示产 物为 单特 异 峰 , t 2 O 30 相 .9; T 为 8 . ±O℃; 内变异 系数 ( V ) 4 2 ; 间试验 无显 著差 异 ( m 25 组 C 为 .6 纽 P> 0 0 ) . 5 。建 立 的检 测鸭 I N F 一mR NA 的 R a t ― C el i RT P R方 法具 有检 测 范围广 、 增效 率 高、 ― me 扩 特异 性 好 、 重复性 和稳 定性 良好等 特点 。 关 键词 : ; 干扰 素 ; 时荧光 定量 R P R; Y R G enI 鸭 实 T― C S B re 中 图 分 类 号 :8 2 4 ¥ 5 . 2 ¥ 5 . ;8 8 3 文献标识码 : A文章 编 号 :0 75 3 ( O8 O 一0 7O 1 0 ―O 8 2 O ) 5O 1一4干扰 素 ( treo ,F 具 有广 谱抗 病 毒 、 肿 i efr n I N) n 抗型和 Ⅱ型 ,F 属 于 Ⅱ型 I N, T 淋 巴细 胞 和 I N一 F 由瘤和 强大 的免疫 调节作 用 , 目前 临 床 医学 、 是 肿瘤 学 和免 疫学 等 领 域 的研 究 热点 之 一[扪。 I N 分 为 工 F 收 稿 日期 :0 80 - 7 2 0 - 10 N 细胞 产生 。I N一 机 体 的免 疫 应答 过 程 中起 K F 在着重 要 的作 用 , 疾 病 的发 生 、 展 有着 密 切 的关 与 发作 者 简 介 : 秀 兰( 9 O ) 女 ( 谢 18 一 , 回族 ) 宁夏 银 川人 , , 助教 。 士 , 要 从 事禽 病病 原 分 子 生 物 学研 究 。 *通 讯 作者 硕 主[ ] 裒 鸿 昌 , 绍 基 . 滩 地 区 血 吸 虫 病 流 行 因 素 与 优 化 控 制 策 略 8 张 湖2 ―3 . 31 2 7 的研究 [ 中国吸虫病防治杂志 ,9 5 7 4 :9―0 . 刀. 1 9 ,( ) 1 32 1 a A n o d B e 1 mb n d mi r ― [ ] Ka sm O ,De n D ,M a g l L, ta .Co i e c o 9 s i O a t g a h c a h s o a h l g c a a y i f t e f t f h l u o r p i nd it p t o o i n l ss o h a e o c a ― l n e S hit s ma n n o  ̄ s h s o o u a n m ie mmu i e e g c s o o r a s n c it s m l i c i nz d[O Ah alh M,B nae 1] dl i a O e slm H,Au irR,ta. gn s x ge e 1Ariaee ―p e so n p rt n a a r p a e n n r a e i i c l t r s i n i e io e lm c o h g s a d i c e s n c r u a i ng p l mi e l v l n o ya n e e s i mie i f c e t S h s o o ma o i c n e t d wih c it s ma ns n [] C lM o Lf c,0 3 5 :3 01 5. J . e l i S i2 0 ,8 1 5―3 7 l ewi rdae ecr e J .Am o d Hy , 02 4 : t i aitdcrai [ ] hr a JTrpMe g 2 0 , 7 I e tg to n W id Ra s Na u a l nf c e t nv s i a i n o l t t r ly I e t d wihS h soo o iu i i g h u A e fHu e P o i c c its maj p n c m nJn z o r ao b i r vn e a DI NG -i ,ZHAO n ― i, Xuja Ho g me ZHAO h o y n S a― a g( olg f Anma ce c , a g z C l e i l i eY n te e o S n ie st vri y,J n z o ,Hu e , 3 0 5 C i a ig h u bi4 4 2 , hn )Ab t a t I r e O u d r t n h n e t u i a i n o o e i h n t r l n e t d wih S h so o s r c : n o d r t n e s a d t e i f c i s st to f v l s wh c a u a l i f c e t c i t s ma o u yj p n c m ,t ei fci u o dto h o g isc in a d fc le a n t n a o iu h n e t sc n i n t r u h ds e t n e a x mi a i .Th e u t r v d a o― o i o o e r s ls p o e s f l lws h o a fci u aeo l as wa . ,o ih t en t r l n e to sr t so t乱 o ,t ett li e t sr t fwi r t s1 8 n o d 3 9 fwhc h a u al i fciu ae f y Ra t sf a i ets R t sn r e i s atsr t i e ,a dR t sr t swee1 . 1 , 9 1 , . 6, a d lvp c , at ov g c ,R t at d s n at at r 3 5 % 1 . 8 9 7 n u u u u o u u 9 61 . 7 ,,r s e t ey a d t e ifc iu ae ft ea o ef u y e n p o l a ia aa . r h r sa d O 7 6 e p c i l , n h n e t sr tso h b v o rt p s i e pe h b tt r e o c ad n 9 v ofr a dwee 1 . 7 , 0 O n 6 6 ,rs et e .Wi o s nf a tdfee csa n h amln r 3 7 1 . 0, a d 1 . 7 , ep ci l 9 6 9 6 v y t n i i cn i rn e mo g t e h g i ft r ep r e t g sa d b twe n t et e e .Th n e t u a eo h d l g o p wa h ih s ,a d h e e c n a e n et e h WO s x s eifc i sr t ft ea u t r u st eh g e t n o o c s r d t n o a t sr to de s h g e h n t eo h rt r e t p s o y tp o u i f tu a t i swa i h rt a h t e h e y e .Th r sc o e r l to s i ― o R e e wa l s e a i n h p a m o g t e l i g a e s o n e to s V l Sa d t e e it n e o o ii e s a l s we l s t e ri f c i u e ― n h i n r a fi f c i u O e n h x s e c fp stv n i a l a h i n e to sp r v s cent ages .Ke r s W i a s S h so o a o iu ; au ei fcin y wo d : l r t ; c it sma j p n c m n t r n e to d维普资讯 1 8动物医学进展20 年 08第2卷 9第 5 ( 第 1 7期 ) 期 总 7 系 。体 内 I N 及 其受 体 表 达 发 生 异 常 , 机 体 免 F 一 与疫 功能低 下 或发 生 病 理 损 伤 有关 。对 I N一 F 表 因 。5 L 反 应 体 系 : 0 mmo/ NTP L, 0肚 1 lL d s2 2 0mmo/ Mg 1 2 肚 5 lL C 2 L, 上 、 下 游 引 物 ( 0肚 lL 各 1 L、T q NA 聚 合 酶 ( / L 1 mo/ ) aD 5u/ )  ̄0. L 5 C ufr 0肚 、D 5肚 、 ×P R b f e 1 L c NA 2 L, 去离 子 达 量 的准确测 定 , 反映 机体 的免 疫状 态 、 揭示 疾病 的 发 病机 理 、 索感 染后 机 体 的 免疫 应 答 规 律 均 具 有 探重要意 义 。 水 补 足 至 5 L。 反 应 条 件 : 5 ℃ 3 mi ; 5 ℃ O肚 9 n9 3 ,3 7 ℃ 3 , 2 ℃ 3 , 行 4 0S 6 . 0S7 0S 进 0个 循 环 ; 常用 的检 测干 扰 素 的方 法 ( 放 射免 疫 法、 如 E I A、 T法 、 规 RT P R 法 等 ) 同 程 度 上 L S MT 常 ―C 不7 2℃ 5mi; n 4℃结 束 反应 。P R 产物经 2 / C 0g L的 存在 着灵 敏度不 高 、 作 繁 杂 和 难 以准 确定 量 等 缺 操点 。实 时荧 光 定 量 RT P R 技 术 ( a― meR ― ―C Rel i T t P R) 2 C 是 0世 纪 9 0年 代 发 展起 来 的一 项 检测 核 酸 的新 技术 , 以其 灵 敏 、 特异 和快 速 的特 点 , 速 被 迅琼 脂糖凝 胶 电泳 , B染 色 , 外凝 胶 成 像 系统 进 行 E 紫检 测后 , 琼 脂 糖 凝 胶 上 切 下 目 的 片 段 , 用 3S 从 采 S i ao eGe DNA P r i t n Ki 剂 盒 按 pnAg rs l u ic i t试 fa o说 明 书 回收 纯 化 。 以此 纯 化 的 P R 产 物作 为标 准 C应用 于功 能基 因组 、 子 医 学 、 毒 学 、 生 物 学及 分 病 微生 物工艺 学等 领 域 。在 细 胞 因子 的 表 达 研究 方 面 , 品 ,0倍 系列 稀释 后用 于建 立标 准 曲线 。 1 1 3 3 R a t ― C 条 件 的 优 化 采 用 . . e l i RT P R ― me S R Gre YB e n I染 料 法 , i ylri M荧 光 定 量 在 Cc e Rel i - C 已 成 为 主 流 的 研 究 工 具 [ 。 a― meRT P R t 8 而 目前 尚未见 用 该 方法 检 测 鸭干 扰 素一 表达 的报 道 。本试 验建 立基 于 S R Gre 染 料 法 的检测 YB en I 鸭 I N 基 因 的 Rel i T P R 方 法 , 研 究 F 一 a― meR - C t 为 鸭 I N 在 鸭 体 对 鸭 病 原 的应 答 中 的作 用 打下 基 F 一础。 P R仪上 进行 扩增 和 数 据 分 析 。 由于 扩增 片段 仅 C 8 p 为 缩 短 反 应 时 间采 用 两 步 法 。反 应 体 系 为 1b ,2 L, 出现 最 小 的 C 值 和最 高 的荧 光值 , 5肚 以 t 以及不 出现 非特 异 的扩 增 产 物 为 标 准 。分 别对 循 环 条件 、 褪火 温度 、 物浓 度进 行优 化 。 引 1 材 料与 方法 1 1 材 料 .1 3 4 标 准 曲线 的建立 采用 优化好 的条件对 II一 .. F N 进 行 S B re R a t T P R, C 值为 纵 Y R G enI ebi R - C 以 t me 健 康樱 桃谷 肉鸭 , 自成 都某 肉 购 i c ri M Cyl e QT 荧光 定 量 P R仪 , C 坐标 , 以稀释倍 数 的对 数为横坐标 , 建立标准 曲线 。 1 3 5 熔 解 曲线 分析 为排 除非 特 异性 扩 增产 物 ..及 引物 二 聚 体 对 ra t T― C e l i R P R结 果 影 响 的 可 ― me1 1 1 实验 动物 ..鸭场 。 1 1 2 主要 仪器 ..凝 胶成像 系 统 Do2 0 e0 0为 美 国 B oR d公 司产 品 ; i― a Th r b i x h r l y lrP R仪 为 英 国 emoHy adP 2t ema c c C eTh r b i 司产 品 。 emoHy ad公 1 1 3 主要 试 剂 S B P e x Ex T q T .. Y R rmi a M、能性 , P R 结 束 后 进 行 熔 解 曲 线 分 析 以 确 定 在 C P R产 物是否 为 目的片段 。温度 以 0 5℃/ 0S的 C . 1 速率 从 5 5℃缓慢 上升 到 9 4℃ , 续测定 P R产物 连 C的荧 光强 度 以获取熔 解 曲线 。 RNAi a e t T qDN 聚合酶 、 s Reg n 、 a A o RNA P R Ki C t ( AMV) r 3 0均 购 自 T k r Ve. . a aa公 司 ; e E ta― G l x rc 1 3 6 重 复性 和稳 定性 试验 ..1 3 6 1 组 内重 复性 .. . 1 3 6 2 组 间重复 性 .. . 对 同一 样本 的 e DNA设 2 0 对 1 递增 稀释 的标 准 品 0倍t nMii t 自上 海华舜 生 物工 程 有 限公 司。 i n 购 o Ki 1 2 引物 设 计 及 合 成 .复管 同时 检测 , 计算 其 C 值 的变 异 系数 ( v ) t c 。 检测后 于 一2 0℃保 存 ,0 d后 重 检 , 3 比较 前 后 两次 的扩增 结果 和标 准 曲线 的相关 性 。 2 结 果 2 1 标 准 品 制 备 .参考 Ge B n n a k中鸭 I N 7基 因的核 苷酸序 列 , F - 根据 保守 区域 的序列 , 计 1对 用 于荧 光 定 量 P R 设 C 的引物 , 扩增 鸭 I N一 F 基 因 8 p的 片段 。引 物 由 1b 宝 生物 工 程 ( 连 ) 限 公 司 合 成 。上 游 引 物 : 大 有 5一 AAC C G AAGGC TGAGT TG GAG一 ; 3 下游 引 物 : 5一 ACTGGC TC CTTTTCCTTTTGG 一 3。1 3 方 法 . 总R NA 经 反 转 录 合 成 e DNA 后 ,F 一 I N 基 因 进 行 P R 扩 增 , 到 8 p大小 的片 段 , 预期 目 C 得 1b 与 的片段 大小 一致 ( 1 。 图 ) 2 2 S R Gre ra t - C 条 件 的 优 化 . YB enI e l i RT P R ― me1 3 1 鸭 肝 脏 组 织 RNA 的 提 取 与 反 转 录 用 .. R NAi e g n 提取 RNA, 照说 明书进行 。c ― s R aet o 按 D 对 引 物及 退 火 温 度进 行 优 化 , 到 的最 佳反 应 得 体 系为 :YB P e xExT qT 1 . L, 物各 S R rmi a M 2 5 引 0 2/ lL, 板 2 L, d O 9 5 L; .  ̄ / 模 mo d H2 . 最佳 反 应 体 系为 :5℃ 5mi ,5℃ 1 ,3 7℃ 2 , 行 9 n9 5S 6 . 0S进4 0个 循 环。 NA 的合成按 RNA P R Ki AMV) r3 0说 明 C t ( Ve. .书进行 。 13 2 标 准 品制备 以 e NA 为模 板 , h r ― .. D T emoHy b i P×2tema c c rP R 仪 上 扩 增 I N 7基 a d h r l y l C e F 一维普资讯 f 配 U l 芑时 暑 等们 l1 时 tl 们 配U 谢 秀 兰 等 : I N 7mR 鸭 F _ NA 实 时荧 光 定量 R - C T P R方 法 的建 立 1 92 3 标 准 曲 线 .以临界 循环 次 数 ( t值 为纵 坐标 , P R产 物 C) 以 C 的拷 贝数的对 数 为横 坐标 , 得标 准 曲线 ( 2和 图 获 图 3 。结果 表 明 ,F - ) I N 7基 因扩 增 的线 性 范 围广 ( 7 达 个 数量级 , t 在 1 ̄3 之 间)相 关系数 r . 9  ̄ C值 2 3 , =O 9 7 2 4 熔 解 曲 线 .15 0 bp 1 00 bp 50 bp―― I N一 F 基 因片段 P R产 物 的 熔解 曲线 显 示 为 C 单 特异 峰 , 解 温度 Tm 值 为 8 . ±0℃, 明没有 熔 25 说 引物 二聚体 及非 特异 性 扩增 产物 ( 4 。 图 ) 2 5 重 复性 和稳 定性 试验 .∞ O O O O O O O O O 0∞ 如 ∞ ∞ 如们 如加ml l 9 8 71 Makr2 I . r e ; . FN- ; . 7 3 NTC 对 同一 e NA 样 本设 2 D O复管 检测 , N_ 因 ∞ ∞ ∞∞ I 基 F C 值变 异 系数 ( V ) 4 2 , 增 曲线 见 图 5 t C 为 .6 扩 ; 系列 稀释 标 准 品 相 隔 3 0 d的 两 次 检 测 结 果 , 比 经 较, P>O 0 , 明具 有 良好 和重复 性和稳 定性 。 .5 表 0 u 一l∞ I 一 u o I0 lL -图 1 I N_ 因 的 P R 扩 增 产 物 F 7基 CFi . PCR r d c so F 7 g ne g1 p o u t f I N一 e Core a i n Co f i i nt 9 7 S o e - . % r l to e fc e : 7 l p :3 2 0.∞勰 加 m I Nw F: : : 。,; i ;∥ i: l _ i l l ll ㈠ l ; ㈡ ; i I t r e t 3 ? 8 - 2%X+3 ? 8 。 U n e c p : 7 8 0 Y= 3? 78 0n n wn k O sP CR Efi i n y: 01 1 f c e c l . % o S a ad l nd r s0 : l l_ / ll矿 l ;。叠 二 琴 0i _ l £童 l l.、 、 - 删 .。 Y 、 d : : jj , , l £ 。 t 矗垂 ~蠢 i i 蔓 ; . . 0 ._ …、. 一 : …… . 笔 : 蠢 _: 一 一― _ - 1 i 一 蔓 一 一 0 1 2 3 4 5 6 7 lgSat gQu niyc p u e o tri a t ,o yn mb r n t图 2 IN- F 7基 因的 动 力 学 扩增 曲线 Fi . Th y a c a l a i n c r e o FN- e e g2 e d n mi mp i to u v fI c 7g n 图 3 I N 7基 因的 标 准 曲线 (一0 9 7 F - r .9)Fg 3 Th tn a d c r eo F 7 g n ( = 0 9 ) i. esa d r u v fI N- e e r . 97 I N吖 F; ㈠ ; ! i : i i ijji ! l_ j l i 0 - ; 尊下 。 √ 旋 ■ ■ 一一 .E ; i; ji 嚣… i攘 j { 蓬螽 ≤ i j i li NTC i …。 垂 : i 一 露 l蔓 i l N c l■曩 Tl6 Cyc e l 图 4 I N 7 因 的熔 解 曲线 ( F -基 Tm:2 5 " 8 .  ̄0Cl Fi. Th l ur efrI g4 emetc v o FN- g n ( e e Tm : 2 5士 O℃ ) 8. 图5 设2 0复 管 检 测 I N 7基 因 的 扩 增 曲线 F -Fi. Th mpiain c r eo F y g ne( 0 tme ) g5 ea l to u v fI N- e c 2 i s 3 讨 论 生 高 水 平 的 I N一 从 而 维 持 了 潜 伏 感 染 状 态 。 F , 干扰素 对免 疫 反 应 , 炎症 反 应 具 有 重 要 的调 节 T n T 等[ 在 研 究 病 毒 性 肝 脏 纤 维 化 时 , 为 a gJ 3 认 作 用 , 通 过调 节 免 疫 反 应 ( 括 淋 巴 细胞 活化 、 它 包 增 I N一 F 的表 达水 平 与肝 脏 纤 维 化 的严 重 程度 呈 负相 殖 、 化 、 存 和 凋 亡 ) 免 疫 系统 中起 着 重 要 的作 关 。此外 , 分 生 在 对单 纯疱 疹 病毒 ( V) HS 感染 后 I N 表 达 F用 。K i r as e P等[ 研究 鸡 干扰 素对 抗 马立 克 品种鸡 水平 变 化 的 研 究 表 明 , 毒 感 染 能 诱 导 机 体 表 达 1 胡 病 感 染 马立 克病 毒 后 的应 答 , 明病 毒 感 染 可 诱 导 产 I N[ 同 时 HS 通 过 阻 断 I N 信 号通 路 来 抵 抗 表 F 1 , V F维普资讯 2 0动 物 医学 进 展20 0 8年第 2 9卷第 5期 ( 总第 1 7期 ) 7 c a g snteb n ro o o s t i ma is [] Ve h n e h o emarw fdg hls i wi e h noi J . t s Re , 0 6, 5 ( 0 6 0 6 4 c 2 0 1 8 2 ); 9 - 9 .机 体 I N对 其抑 制 作 用 , F 以上 试 验 均 表 明 干扰 素在 疾 病 的发病 机理及 机 体对 各种 病 原微 生物 的免 疫应 答 中发 挥关键 作用 。 为研究 干扰素 的免 疫调 控 机理 、 病毒 与机 体之 间 的相互关 系以及机 体对 病 原体 的免 疫 应答 , 干扰 素 对 m NA表达 的准 确定 量 是非 常重要 的 。然 而 干扰 素 R 含量很低且 蛋 白半 衰期 短 , 常用 检测 干扰 素 蛋 白及 基 因的方法 ( E IA、 如 L S 放射免 疫法 和免疫荧光 法 、 T MT 法、 常规 P R法等) 同程度地存 在着灵敏 度低 、 C 不 操作 复杂 、 污染 环 境 、 时 和 难 以精 确 定 量 , 耗 对操 作 者 、 环 [] Fec i . n einsse t it omyo atr l ies. e 5 ish C Me d l ucpi lyt cb cei saed - a bi ad fcsi teI-2 I N a et h L 1/F g mma ah yJ . rs d 2 0 ,5 n twa [] P esMe ,0 6 3 p( - ): 7 - 8 . 5C2 8 9 8 6 [] Ka gBY, m .Tag t gctkn so h trekn1 6 n Ki T S rei yo ie ftei elu i-2 n n fmi uommu i [ ] C r d C e 2 0 , 3( O ; a l i a ti yn nt J . ur Me h m, 0 6 1 1 ) y1 4 - 1 6 1 915 .[ ] Hiu h D ln e W a hPS e 1 i l n osa l 7 g ci R, ol g r i G, l , t .Smut eu mpi s a a ― f aina dd tcin o pcf i t n eet fseicDNA sq ecs J .Boeh c o o i eu n e[] itc―n lg o o y,1 9 9 2,1 41 - 7 0; 3 41 .[ ] B si 8 u t S A,B nsV,Noa e 1Qu ni t era-me n e e ln T, ta. a t ai eli t v t境造成毒 害 的 问题 。而 R - C 是 目前 国内 外检 测 TP R核酸最 为快 速 ( 制 备 样 品 到 报 告 结 果 仅需 1h 从 ~3 h、 ) 灵敏 ( 低 可 以检 测 到一 个 基 因 的拷 贝) 高通 量 最 、 ( 1次可 以同时检 测 9 6个 或 3 4个 样本 ) 8 和特 异 的方 法, 在细胞 因子 的定量 中越 来 越 受 到青 睐 。因此 , 本 试验建立 了基于 S B re 染 料法 的检 测鸭 IN- Y R G enI F 7 NA的实时荧光定 量 R _C mR T P R方法 。从试验 结果 可 以 看 出 , 建 立 的 检 测 鸭 WN 7基 因 的 r l i 所 - e -me atR P R-aprpcie J. l n o ,0 5 3 :9-0 . T-C es et [] JMoeE d c2 0 ,4 5 76 1 v [ ] Z agZ, ahrd i Dol e 1Cyo iea dT ll e 9 h n B s i dnJB, e C,t . tkn n oli u a ―kr cp o e e t r mRNAs i t e a a . s o i t d l m p o d i s s o n h n s 1a s ca e y h i ts ue fct ed r gfo-n- uhdsaevrsifcin J. o at ui t dmo t i s iu et [] JC mp l n o a e n oPaho ,00 t 12 6,1 4( ): 0 6 . 3 1 6 ― 6 [O L eY W , rn A, pin uN,ta. ma 1 ] e Hiai A Ky r o e 1Hu ni a mmu o e n d―f i n y r S 1 Ta r t i p r g l t s i t re k n 6 a d i ― i e c u - t p o e n u - e u a e n e l u i - n n ctrekn8e pes n i u n b es a crcl [ ] n elu i- x rsi n h ma ratcne el J .I- o sfa lmm s 2 5, 4 9 3 0 3 9. Ra ,00 5 ( ): 8 ― 8 R -C T P R方法具 有 检 测 范 围广 、 异 性 好 、 增 效 率 特 扩 高 、 复性和稳 定 性 良好 等特 点 , 进 行 鸭病 原 与 鸭 重 为体相 互关系 的研究 打下基础 。 参考 文献 : [ ] P zasa aV 1 oh rk y P,W eka dL L a ln ,OfemanM Ihbt n fr n K. n iio io n e to s hu n h r e v r s 8 p o c i n b a f i f c i u ma e p s i u r du to y g mma i t r n e―[ 1 An wot M , peo A, ik r ,t 1Th f c f 1] is rhD Ap ltnJ Ec e W e . e f t S a ee osr n u x r ieo RNA o c n rto s o n e lukn 1 te o se ecs n m c n e tain fit re i- 2,i e f r n g mm a a d i t re k n 4 i q i e p l n r a d nt r e o - a n n e l u i - n e u n u mo a y n p t h rl lo n n cercl [] 、 mmu o I ei ea o dmo o u la el J . t p b s I n l mmu o n―p to12 0 9 ( ): 47l ah , 0 3, 1 1 6 ― J[2 Hom Ny odC G, lu a e 1Itr u i-1 _ NA 1] l C, v l Pa d nSR,t .nel kn2 R a e m ep es nd r gvr sifcin [] C tkn ,0 6 3 ( ) x rsi ui i et sJ . yo ie2 0 。3 1 : o n u n o4 - 5 14 .frna d a h nefrni C L 1cl [ ] n Vi l eo n l aitreo n B B 一 el J .JGe r , p s o 2 0 8 ( 0 2 7 ― 7 7 0 4, 5 1 ): 7 92 8 .[3 Kasr 1] i e P,Un ew o Daio . i eenil yo ier― d r o dG, vsn F Df rrt tkn e f ac s o s sf l wig m a e sds a e vr sifc in o hik ns p n e ol n rk, ie s iu n e to fc c e o[ ] F yE, i W a gC,t 1Re uai fnefrnrg l in 2 o L K, n e . g lt no tr o eua o a o i e t fco- yteh p ti C vrssr epoes [ ] S i c, atr3b h eais i ei ttae J . c n e t u n e2 0 3 0: 1 5 1 4 . 0 3, 0 1 4 - 1 8 df r gi eitn et rk sdsaeJ . r12 0 ,7 iei rssa c omae , ies[] Jvi ,0 3 7 f n n o( ): 6 ― 6 1 7 2 7 8.[ ] TagJT, a gJY, Q,ta. e 3 n F n Guw e 1T cl i lmmmu epn ei ers o s sc r l t d wih fb o i n n lm ma o y a tv t n h pa ii or ea e t r ss a d i fa i t r c i iy i e ttsB [4 P d re Hah , g ne . l k drs tneo 1] eesnE B, a rS Mo e snSC x―n e ei a c f i smi e t i h d s s of h r e i p e iu y e 2 c r e a e c o h g o e e p s sm lx v r s t p o r lt scrh t sJ. ol G sre trl2 0 ,2 1 ) 3 1―0 9 iroi [] W r J ato neo ,0 6 1 ( 9 :0 53 1 . c d [ ] F gi Ma z l RetciB, a a oA.e 1 P too i l 4 o l nio V, suc a l P gn ta. ah lgc awi al tr rn po u t n[ ] Ifc mmu , 9 3 2 t er i ef o rd ci J .netI h yn e o n 1 8 ,4 ( ): 4 ― 4 . 2 7 0 7 6 Es a ih e f Re ltm e RT- t bls m nt o a - i PCR o FN- RNA n c f rI ym i Du kXI Xi -a ,TANG h n E u l n C e g ,YANG a l n F ―o g ,YUE u H a(. olg fL f cec n cn lg 1C l e e o i eS i e d Teh oo y,S uh s U iest o t n l is C e g u S cu n 6 0 4 , hn n a o twet nvri f rNai ai e , h n d , ih a , 10 1C ia; y o t 2 De at n fM i oilg n mmu oo y, ahScu nMe i lC le e Na c o g,ih a ,3 0 0 C ia . p rmet c boo ya d I o r nlg No ih a dc olg , nh n S c un 6 70 , hn ) aAb t a t Ac o d n o t e d c F g n e u n e v i b e i n a k,a p i o rme s we e d ― s r c : c r i g t h u k I N一 e e s q e c s a a l l n Ge B n a ar f p i r r e sg e o s a l h n YB Gr e u n ia i e r a ―i in d fre t bi i g aS s R e n Iq a tt tv e l me RT- CR e h d f r I N一 mRNA fd c t P m t o o F o u k. To e t b i h t e s a d r u v , h r d c fc n e t n lP s a l h t n a d c r e t e p o u t o o v n i a CR e v d a t n a d f l wi g wi h s o s r e sas a d r ,o l n t t e o ha ay i o li g c r ea d t e sa i t e t n l ss fmetn u v n h t bl y t s.Th e ut h we h tt e l e rr n eo au s i e rs lss o d t a h i a a g fCtv l ewa n fo 1 . - 3 0 wih a g o o r lto o fiin ( = 0 9 7 n h r sa sn l e k wih a 8 . ± r m 2 0 3 . t o d c rea in c efce t r . 9 )a d t e e wa i ge p a t 2 50 ℃ Tm n m etn u v . Th o fe in s o a it n( V ) s 4 2 i lig c r e e c ef ce t fv rai o C wa . 6.f r t e itaa s y t s n o h n r― s a e ta dt e ewa o sg i c n ifr n e( > O 0 )n t eit ra s yt s Th e l i eRT~ CR s a o u k h r sn in f a tdfe e c P i . 5 i h e- s a e t n er a― m t P a s y f rd c I N一 m RNA a r a a g ,h g fii n y p c f iy a d r l b l y F h sb o d r n e i h e fce c ,s e i ct n e i i t . i a iKe r s d c I N一 Re lt ywo d : u k;F ; a―i RT― CR; YB Gr e I me P S R e n
更多搜索:
All rights reserved Powered by
文档资料库内容来自网络,如有侵犯请联系客服。